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Ingénieur de recherche en traitement d'images biomédicales et apprentissage automatique H/F

Recruteur : CEA

Type de contrat : CDD

Date de publication : 29/12/2017

Descriptif de la mission et du profil recherché

Description de l'offre

L'ingénieur(e) de recherche rejoindra l'équipe BrainOmics, dédiée à la neuroimagerie-génétique, et travaillera en étroite collaboration avec la plate-forme d'analyse d'images de NeuroSpin. Cette équipe analyse des données multimodales pour étudier de nouveaux biomarqueurs et des modèles du cerveau. Les applications sont des neurosciences fondamentales comme le développement du cerveau ou les neurosciences cliniques en neuro-oncologie ou encore l'autisme.

- Il/elle prétraitera les données IRM structurelles, fonctionnelles ou encore de diffusion en adaptant les pipelines à l'état de l'art de la plate-forme (SPM, FSL, FreeSurfer, pyRadiomics, Deepmedic, etc.)
- Il/elle construira des banques de caractéristiques riches et originales (phénomes) pour les cohortes disponibles à NeuroSpin
- Il/elle supervisera les tâches de calculs sur clusters (CPU, GPU) pour les analyses d'association phénomes-génome qui mettent en œuvre les méthodes d'apprentissage automatique à l'état de l'art (scikit-learn, ParsimonY)
- Il/elle participera à la communication scientifique des résultats des projets du groupe

Profil du candidat

Niveau : PhD ou Master/Ingénieur + 3 ans d'expérience
Domaine : Traitement d'image médicale (ou signal) et/ou statistiques/apprentissage.
Compétences : Expérience en développement logiciel sous Python/Git/Linux en milieu professionnel ou durant la thèse.

Curiosité, autonomie, rigueur, travail en équipe, communication orale et écrite. Anglais scientifique.
Les connaissances en neurosciences, neuro-oncologie ou bioinformatique sont un plus.

Descriptif de l'organisation

Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche. Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions : . la défense et la sécurité . l'énergie nucléaire (fission et fusion) . la recherche technologique pour l'industrie . la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie). Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.

Informations Complémentaires

Fonction publique

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